在此過程中，犯罪嫌疑人和辯護律師有可能提出排除非法證據的申請。根據申請的各種情況，檢察院會有不同的處理方式。

在犯罪嫌疑人申請排非的情況下檢察院的處理方式主要有以下4種：

1、人民檢察院應當調查核實；犯罪嫌疑人及其辯護人申請排除非法證據，并提供相關線索或者材料的。 2、人民檢察院要全面審查案件事實、證據；犯罪嫌疑人申請排除非法證據，但未提交相關線索或者材料的。其中在審查逮捕階段未發現偵查人員存在以非法方法收集證據的情形，認為符合逮捕條件的，可以批準逮捕。 3、來不及落實的可在批捕后繼續對可能存在的非法取證行為進行調查核實；審查逮捕期限屆滿前，經審查無法確定存在非法取證的行為，但也不能排除非法取證可能的，該證據不作為批準逮捕的依據。檢察官應當根據在案的其他證據認定案件事實和決定是否逮捕，但在作出批準或者不批準逮捕的決定后， 應繼續落實。 4、發現和核實后符合條件的要排除非法證據。無論在哪個階段，發現偵查人員確有以刑訊逼供等非法方法收集證據的，應當依法排除相關證據并提出糾正意見。

檢察院在刑事訴訟過程中，在犯罪嫌疑人和辯護律師提出來排除非法證據的申請后，應該根據是否提供了相應的線索和證據確定是落實線索還是全案審查，對于存疑的證據暫時不得使用，在期限內應該繼續對有關非法證據問題進行落實。無論在何種階段，發現和落實了非法證據的時候都要進行排除。排除非法證據后，犯罪嫌疑人不再符合逮捕條件但案件需要繼續審查起訴的，應當及時變更強制措施。案件不符合起訴條件的，應當作出不起訴決定。這些強制性的規定從本質上都是為了保護犯罪嫌疑人的權利！