公安機關對退回補充偵查的案件，根據不同情況，報縣級以上公安機關負責人批準，分別有以下5種處理方式：

1、制作補充偵查報告書，移送人民檢察院審查； 原認定犯罪事實不清或者證據不夠充分的，應當在查清事實、補充證據后，制作補充偵查報告書，移送人民檢察院審查。

2、書面說明無法補充的情況； 對確實無法查明的事項或者無法補充的證據，應當書面向人民檢察院說明情況。

3、重新制作起訴意見書，移送人民檢察院審查； 在補充偵查過程中，發現新的同案犯或者新的罪行，需要追究刑事責任的，應當重新制作起訴意見書，移送人民檢察院審查。 4、撤銷案件或者對犯罪嫌疑人終止偵查，并將有關情況通知退查的人民檢察院； 發現原認定的犯罪事實有重大變化，不應當追究刑事責任的，應當撤銷案件或者對犯罪嫌疑人終止偵查，并將有關情況通知退查的人民檢察院。

5、認為退回補充偵查不當的，應當說明理由，移送人民檢察院審查。 原認定犯罪事實清楚，證據確實、充分，人民檢察院退回補充偵查不當的。

公安機關在接到檢察院退回補充偵查的法律文書之后，如果是第一種情況就應當在一個月內按照補充偵查提綱補充偵查完畢，制作補充偵查報告書。此外的四種情況，就是公安機關在接到退回補充偵查的法律文書后，根據案件實際情況可以采取的措施。有關刑事案件的互相配合、互相制約，就體現在這些細致的法律規定中！