在完成移交程序后，李四放棄了張三的所有股東權益。協(xié)議簽署后，張三在工商登記管理部門的股東由李四變更為王五。然而，張三沒有向李四支付股權款項，李四向法院提起訴訟，要求王五支付40萬元股權轉讓款。王五辯稱，股權轉讓協(xié)議約定的支付主體為張三公司，張三公司申請的銀行貸款目前尚未獲得批準，無法支付股權轉讓款。人民法院不支持王五的辯護，裁定王五向李四支付40萬元股權轉讓費。 在股權轉讓過程中，同意將公司部分財產作為股權轉讓資金的，其行為是處置公司資產，這將導致該部分股權對應的出資缺陷，類似于撤回出資，股權轉讓時的轉讓資金可能遠遠大于原注冊資本。本協(xié)議違反《公司法》強制性規(guī)定，侵犯公司財產，損害第三方利益。因此，如果《股權轉讓協(xié)議》規(guī)定以公司財產作為股權轉讓價款，則本協(xié)議中關于該部分的協(xié)議因損害第三方利益而無效。

但在《股權轉讓協(xié)議》中，以公司部分財產作為股權轉讓價款的協(xié)議無效，不影響本協(xié)議其他協(xié)議的效力。其他約定的部分仍然有效。因此，股權受讓人仍需根據股權轉讓協(xié)議支付相應的股權轉讓價款。