電子商務系統是商務與技術結合的產物，所以在電子商務應用的全過程中，都必須充分兼顧這商務和技術兩個方面的因素，以科學、合理的程序展開系統設計、建設和應用工作。如果按階段劃分，要實現電子商務應用，電子商務系統建設大致需要經過下列五個階段：

1、商務分析階段

這是實現電子商務應用計劃的第一步。這一階段的工作主要是進行充分的商務分析，主要包括需求分析(包括企業自身需求、市場需求以及客戶需求等)和市場分析(包括市場環境、客戶分析、供求分析和競爭分析等)兩個方面。

在電子商務條件下，市場范圍擴大，創新速度加快，競爭的壓力越來越大，競爭的頻率越來越高，因此必須對擬建的電子商務系統在未來可能面臨的競爭盡可能做出分析，最大限度地避免競爭失利。此外，還要對企業自身狀況進行分析，包括對企業組織、管理、業務流程、資源、未來發展的分析，等等。要結合電子商務的特點，從供應鏈的角度重新審視企業組織、管理與業務流程，尋找與電子商務的最佳結合部。

2、規劃設計階段

在完成上述商務分析的基礎上，在掌握電子商務最新技術進展的情況下，充分結合商務和技術兩方面因素，提出電子商務系統的總體規劃，提出電子商務系統的系統角色，提出電子商務系統的總體格局，亦即確定電子商務系統的商務模式，以及與商務模式密切相關的網上品牌、網上商品、服務支持和營銷策略四個要素。電子商務系統設計工作可以由此展開，也即從子系統、前臺、后臺、技術支持、系統流程、人員設置等各個方面全面構架電子商務系統。此階段的工作完成的好壞，將直接關系到后續電子商務系統建設和將來電

子商務系統運行和應用的成功與否。

3、建設變革階段

這個階段的工作分為兩條線：一條線是按照電子商務系統設計，全面調整、變革傳統的組織、管理和業務流程，以適應電子商務運作方式的要求;另一條線是按照電子商務系統設計，全面進行計算機軟硬件配置、網絡平臺建設和電子商務系統集成，完成電子商務系統技術支持體系的建設，從技術上保障電子商務系統的正常運作。