在案件線索經調查核實未進入立案程序的案件，除了存在一個偵查部門對案件來源反饋的問題，還有一些后續問題需要處理。

檢察院對自行偵查案件線索決定不予立案后，需要處理的后續問題有以下3個： 1、需要追究其他責任的，應該移送 人民檢察院認為被控告人、被舉報人的行為未構成犯罪，決定不予立案，但需要追究其黨紀、政紀、違法責任的，應當移送有管轄權的主管機關處理。 2、為被錯告人消除影響 錯告對被控告人、被舉報人造成不良影響的，人民檢察院應當自作出不立案決定之日起一個月以內向其所在單位或者有關部門通報調查核實的結論，澄清事實。 3、對誣告陷害人移送處理 屬于誣告陷害的，應當移送有關機關處理。

檢察院負責案件偵查的部門，在對案件線索進行調查核實后，如果案件線索不能立案或者不夠立案的條件，不僅應該根據案件線索的來源對有關部門進行通報，同時對控告人、舉報人進行告知。還要注意對應追究其他責任案件的移送，更要注意保護被錯告人！對于利用控告、舉報方式進行誣告陷害的，同樣應該給與相應的打擊，這也是檢察工作的應有之意！