從你所述情況看，公司存在無故克扣員工工資的違約情形，并且違約解除合同，除了應足額支付工資外，還應支付經濟補償金。
　　也就是說，你有權要回6各月底薪，并有權要求公司支付經濟補償金、違約金。
　　 具體關于你的問題： 1.
　　我是先交辭職申請，再去勞動部門申訴還是先申訴再辭職 首先，你不是陳述公司要把你辭職嗎，那就等公司發出辭退通知再行提請仲裁；如果公司沒有發出辭退通知，而你直接前往提請仲裁，有關經濟補償金恐難以得到支持；如果你現行提請勞動仲裁，實質上構成提出解除合同（即辭職），建議不要主動提交辭職申請（切記），公司很容易以此做文章，主張是你員工自動離職的。
　　 2.
　　有人說勞動仲裁費時費力，而且勝訴的可能還不高，是這樣嗎？
　　 勞動仲裁制度是中國特色的嚴重偏向保護勞動者權益的勞動保障制度之一，實際運作起來，省時省力省錢，大量的實踐證明，仲裁委一般都會認真考慮勞動者（弱者）的主張，并予以切實維權；實際上，勝訴不勝訴，關鍵在于員工提出的主張合不合理有無依據。
　　 3.
　　如果直接在法院訴訟的話有什么流程，大概要多少費用？
　　 勞動爭議必須先進性仲裁，勞動仲裁是處理勞動爭議的前置程序；勞動者不能直接向法院提起訴訟，法院不會受理的；勞動爭議仲裁不收費。
　　勞動爭議仲裁委員會的經費由財政予以保障。
　　 4.
　　在合同中，勞動報酬那部分，有一條是“甲方實行新的工資制度或乙方崗位變動時，乙方的工資待遇按甲方規定予以調整”公司現在說不發底薪了我還可以申訴回來嗎？
　　 你可以提出主張，根據國家統計局《關于工資總額組成的規定》，工資總額由下列六個部分組成：（一）計時工資；（二）計件工資；（三）獎金；（四）津貼和補貼；（五）加班加點工資；（六）特殊情況下支付的工資。
　　而根據你的情況，你的工資應包括合同約定的底薪 提成工資等，你可以提出相應主張。
　　勞動爭議中，有關工資、考勤等，應由用人單位舉證。
　　 最后，建議直接向勞動仲裁部門提請仲裁，具體你可以直接前往勞動局咨詢辦理，提出的主張可包括： 1、足額補發工資并支付違約金； 2、支付相當于1個月工資標準的經濟補償金（你從2010年4月參加公司，若1月解除合同，則不到一年，按一年算，一年一個月工資補償）； 3、其他違約違法情形：諸如未支付加班費、未足額繳納社保醫保等。
　　

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