建筑企業合同管理制度主要有以下幾種：

1.建筑企業內部合同預簽制度

2.建筑企業內部的審查、批準制度

為了保證建筑企業簽訂的合同合法、有效，必須在正式簽訂合同之前履行審查、批準手續。將預簽的合同交給企業主管合同的部門和企業的法律顧問，由他們再對預簽的合同進行審查，看是否存在合同瑕疵。通過嚴格的手續，使合同的簽訂建立在可靠的基礎上，盡量減少或者避免合同糾紛的發生，切實保護企業的合法權益。

3.嚴格保護、保管企業印章制度

企業印章包括企業所有的公章、合同專用章等能代表企業進行對外業務往來，并能發生法律效力的一種憑證。因此，企業應對企業公章、合同專用章的使用采用登記制度并設專人保管。凡外出簽訂合同時，應由合同專用章管理人員攜帶合同專用章，與負責辦理簽約的人員一起前往簽約。

4.檢查和獎勵制度

發現和解決合同履行中的問題，協調建筑企業各部門在履行合同中的關系，企業應建立合同簽訂、履行的監督檢查制度。通過檢查及時發現合同履行管理中的薄弱環節和矛盾，以利于提出改進意見，促進企業各部門不斷改進合同履行管理工作，提高企業的經營管理水平。

5.完善合同統計考核制度

合同統計考核制度，是施工企業整個統計報表制度的重要組成部分。完善合同統計考核制度，是運用科學的方法，利用統計數字，反饋合同訂立和履行情況，通過對統計數字的分析，總結經驗，找出教訓，為企業經營決策提供重要依據。

6.建立合同管理評估制度

合同管理制度是合同管理活動及其運行過程的行為規范，合同管理制度是否健全是合同管理的關鍵所在。因此，建立一套有效的合同管理評估制度是十分必要的。

7.推行合同管理目標制度

合同管理目標制度是各項合同管理活動應達到的預期結果和最終目的。合同管理的目的是，建筑企業通過在合同的訂立和履行過程中進行的計劃、組織、指揮、監督和協調等工作，促使企業內部各部門、各環節互相銜接、密切配合，使人、財、物各要素得到合理組織和充分利用，保證企業經營管理活動的順利進行，提高工程管理水平，增強市場競爭能力，達到高質量、高效益，滿足社會需要。

8.建立合同管理質量責任制度

這是建筑企業一項基本管理制度。它具體規定企業內部具有合同管理任務的部門和合同管理人員的工作范圍，履行合同中應負的責任，以及擁有的職權。

建筑企業，應大力加強合同管理，完善企業內部合同管理的體制，不僅有利于提高企業自身的現代化管理水平，也可以有效地控制建設工程的質量和造價。更重要的是，良好的合同管理制度是避免、預防和減少糾紛的有效手段。建筑企業必須建立一套較為完善的合同管理體系，并輔以相關機構，設置專門合同管理人員，制訂一系列完備的合同管理制度，同時加強現代化的信息管理制度并發揮相應的作用，服務于建筑企業的一切商務活動。