公積金逾期是會上征信系統的。

住房公積金若是出現逾期還款的情況，處理方式還要依據借款人選擇的還款方式決定。

一、自由還款方式下逾期還款
1、首先，借款人可以通過貸款服務中心電話查詢下一次還款時需要償還的將貸款額度，包括應還款額度，逾期還款產生的罰息，在下一次還款時將這些款項還清的話，那么就不算作逾期還款了。

2、借款人在非合同約定的還款日償還逾期貸款，須借款人本人持身份證原件及復印件各一份，到貸款業務部門柜臺辦理相關手續。
借款人先向貸款業務部門提出申請，設定一個約定還款日。
需要注意的是，借款人每期只能到柜臺辦理一次非合同約定還款日提前償還逾期的手續，并且借款人應在還款日七個工作日之前到柜臺辦理。

二、等額本金或等額本息下逾期還款
在選擇等額本金或者是等額本息還款方式的情況下，大家只需要將需要償還的貸款額度以及貸款罰息打入賬戶，由銀行統一扣除，借款人不需要提前進行預約。

逾期是會影響征信的，以后記得按時還款。

根據貸款銀行與借款人簽訂的《借款合同》約定，借款人應在貸款發放后的次月按月還款，具體方式有兩種，由借款人自行選擇：
每月1-20日到貸款銀行用現金償還貸款本息；
委托貸款銀行代扣償還。
借款人與貸款銀行簽訂《代扣還款協議書》，并辦理個人還款儲蓄卡。
借款人可以一次預存多個月份的還款金額，也可以在每月20日以前就近在銀行儲蓄所存入足額的還款金額，由銀行直接從借款人儲蓄帳戶中扣劃應還貸款本息。

借款人可以提前一次性償還全部貸款本息，也可以提前償還部分貸款本金：
提前償還全部貸款本息，貸款銀行將按照貸款實際占用的天數重新核定借款人剩余部分的貸款本息；
提前償還部分貸款本息，貸款銀行按剩余的貸款本金重新計算借款人的月還款金額或貸款期限。

住房公積金貸款一般在扣除個人房貸時，并不會在當天早晨就進行扣除。
如果個人說的是第二天賬戶才有資金，建議個人聯系銀行方面看是否有逾期，同時也可以提供相應信息確認逾期并不是由于個人方面造成，從而可以將記錄消除的。

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