從最高檢的規定來看，有關搜查的規定與公安部的規定大體相似，但也有幾處明顯的差別。

檢察院自偵案件中搜查的規定，與公安部《公安機關辦理刑事案件程序規定》中的規定主要有以下6個方面的不同：

1、增加了工作地點作為可以搜查的范圍；為了收集犯罪證據，查獲犯罪人，經檢察長批準，檢察人員可以對犯罪嫌疑人以及可能隱藏罪犯或者犯罪證據的人的身體、物品、住處、工作地點和其他有關的地方進行搜查。

2、明確了搜查的人員；搜查應當在檢察人員的主持下進行，可以有司法警察參加。必要時，可以指派檢察技術人員參加或者邀請當地公安機關、有關單位協助進行。

3、規定了緊急情況搜查后24小時補辦搜查證手續；在執行逮捕、拘留的時候，遇有法定的緊急情況時，不另用搜查證也可以進行搜查，但搜查結束后，搜查人員應當在二十四小時以內補辦有關手續。 4、增加了對被搜查人及家屬說明法律責任的環節；進行搜查時，對被搜查人或者其家屬說明阻礙搜查、妨礙公務應負的法律責任。

5、增加了對阻礙搜查的處置措施；對以暴力、威脅方法阻礙搜查的，應當予以制止，或者由司法警察將其帶離現場。阻礙搜查構成犯罪的，應當依法追究刑事責任。

6、缺少有關搜查筆錄的規定。檢察院的規則中沒有這一方面的規定。

在檢察院自偵案件有關搜查的有關規定中，雖然對緊急搜查的補辦手續和說明阻礙搜查的責任以及對暴力、威脅方式阻礙搜查的處置有了明確規定，但是，在制作搜查筆錄方面的規定卻是空白，這表明檢察院在進行搜查時，對程序性的問題規定不明。雖然檢察院的有關規定接近700條，但檢察院辦理自偵案件時搜查行為的規范，在部分環節上還是有缺陷！