公安機關偵查終結的案件，案件偵查終結時的證據確實充分應當注意把握以下3個方面：

1、排除非法證據 公安機關應當全面審查證明證據收集合法性的證據材料，依法排除非法證據； 2、按照排非后證據確定案件情況 排除非法證據后證據不足的，不得移送審查起訴； 3、對非法取證應處理。 公安機關發現偵查人員非法取證的，應當依法作出處理，并可另行指派偵查人員重新調查取證。

公安機關對于案件偵查終結時證據確實充分的把握，核心的問題首先指向非法證據的排除。只有排除了非法證據后案件仍然能夠達到標準才能移送起訴，如果排除非法證據之后無法達到證明犯罪的程度，案件就不得移送起訴。對于非法取證的偵查人員也要做出相應的處理。所有的這些規定，都是程序法上毒樹之果有毒理論的落實！