保險公司不報的醫藥費應該由責任方進行償付。 如果是車禍，則一般由責任認定肇事者承擔賠償責任；如果是工傷，根據我國法律規定，用人單位參加工傷保險后，社會保險經辦機構應當按照工傷保險藥品目錄、診療目錄報銷工傷醫療費。但是，對于超出工傷保險報銷范圍的部分，到底應當由誰承擔，我國法律沒有做出明確規定，部分法院以用人單位應當承擔無過錯責任為由，判決由用人單位來承擔不能報銷的部分；少數地方法院以用人單位已經盡到了繳納工傷保險費的基本義務為由，由勞動者來承擔不能報銷的部分。【法律依據】《工傷保險條例》第十七條，職工發生事故傷害或者按照職業病防治法規定被診斷、鑒定為職業病，所在單位應當自事故傷害發生之日或者被診斷、鑒定為職業病之日起30日內，向統籌地區社會保險行政部門提出工傷認定申請。遇有特殊情況，經報社會保險行政部門同意，申請時限可以適當延長。用人單位未按前款規定提出工傷認定申請的，工傷職工或者其直系親屬、工會組織在事故傷害發生之日或者被診斷、鑒定為職業病之日起1年內，可以直接向用人單位所在地統籌地區勞動保障行政部門提出工傷認定申請。按照本條第一款規定應當由省級社會保險行政部門進行工傷認定的事項，根據屬地原則由用人單位所在地的設區的市級社會保險行政部門辦理。用人單位未在本條第一款規定的時限內提交工傷認定申請，在此期間發生符合本條例規定的工傷待遇等有關費用由該用人單位負擔。