上班遲到單位扣工資不違法。勞動者肆意遲到等行為應屬于違反勞動紀律，用人單位應當有權在規章制度或企業獎懲制度中，對此類行為進行一定的處罰，以實現雙方的權利義務平等。勞動者如存在肆意遲到等行為應屬于違反勞動紀律，企業和雇主維護自身合法權益制定，合乎情理的考勤扣款是被允許的，而一些用人單位超出員工正常日薪的罰款肯定是不合法的。【法律依據】《勞動法》第五十條，工資應當以貨幣形式按月支付給勞動者本人。不得克扣或者無故拖欠勞動者的工資。