交通事故工傷，第三方保險公司賠償和工傷保險待遇是兩個體系的保障。根據交警出具事故責任認定書中，責任同等，第三方保險公司賠償您在事故中的損失的50%，其中包括但不限于醫療費用。工傷保險待遇是社保待遇的一部分，因超出一個月的工傷申報期，受傷職工工傷醫療費用由單位負擔，單位應全額負擔。但是若第三方保險公司已賠償您該部分費用，則工傷保險待遇不重復保障。單位在賠付工傷職工醫療費用時，以調解內容為由，認為受傷職工放棄第三方賠償，根據事故責任劃分，單位只賠付受傷職工50％的醫療費用，沒有合法依據。法律依據：《道路交通事故處理程序規定》　　第十四條　具有本規定第十三條規定情形，當事人自行協商達成協議的，填寫道路交通事故損害賠償協議書，并共同簽名。損害賠償協議書內容包括事故發生的時間、地點、天氣、當事人姓名、機動車駕駛證號、聯系方式、機動車種類和號牌、保險憑證號、事故形態、碰撞部位、賠償責任等內容。